Skip to main content

Advertisement

Table 2 Percentages of genome annotated as transposable elements (TEs)

From: Comparative genomic data of the Avian Phylogenomics Project

Species LINE SINE LTR DNA RC Unknown Total
Merops nubicus 5.01 0.07 1.30 0.14 0.01 1.26 7.78
Picoides pubescens 18.20 0.05 0.89 0.17 0.00 2.84 22.15
Buceros rhinoceros 3.62 0.08 1.05 0.16 0.01 1.09 6.00
Apaloderma vittatum 5.97 0.12 1.31 0.23 0.01 0.82 8.44
Leptosomus discolor 2.93 0.12 1.32 0.19 0.01 1.88 6.45
Colius striatus 6.54 0.10 2.19 0.19 0.00 0.39 9.42
Haliaeetus albicilla 2.55 0.14 1.71 0.19 0.01 0.77 5.37
Haliaeetus leucocephalus 2.01 0.17 1.89 0.22 0.00 2.59 6.89
Cathartes aura 2.21 0.17 1.05 0.19 0.00 0.92 4.54
Tyto alba 2.64 0.13 1.79 0.19 0.01 0.74 5.49
Geospiza fortis 3.65 0.06 3.37 0.31 0.04 0.80 8.23
Taeniopygia guttata 3.79 0.06 4.11 0.32 0.02 1.39 9.68
Corvus brachyrhynchos 3.73 0.07 2.43 0.22 0.02 0.90 7.37
Manacus vitellinus 4.43 0.08 1.08 0.25 0.01 0.72 6.58
Acanthisitta chloris 6.38 0.10 1.46 0.21 0.01 0.56 8.72
Melopsittacus undulatus 6.49 0.08 1.97 0.20 0.01 0.45 9.19
Nestor notabilis 4.60 0.10 1.32 0.18 0.00 0.37 6.57
Falco peregrinus 3.09 0.15 1.27 0.28 0.00 0.71 5.50
Cariama cristata 3.51 0.18 0.91 0.20 0.00 0.69 5.49
Egretta garzetta 3.92 0.12 1.42 0.24 0.01 1.22 6.93
Pelecanus crispus 3.94 0.15 1.87 0.21 0.01 1.27 7.45
Nipponia nippon 3.69 0.13 1.22 0.29 0.01 0.83 6.16
Phalacrocorax carbo 3.95 0.16 1.29 0.21 0.00 0.62 6.23
Aptenodytes forsteri 2.41 0.20 1.17 0.26 0.00 1.46 5.50
Pygoscelis adeliae 3.31 0.20 1.32 0.26 0.00 0.95 6.04
Fulmarus glacialis 2.86 0.18 1.19 0.22 0.01 0.87 5.32
Gavia stellata 3.17 0.14 0.71 0.22 0.01 0.85 5.09
Eurypyga helias 4.61 0.10 1.60 0.15 0.00 0.46 6.92
Phaethon lepturus 3.91 0.12 1.71 0.22 0.00 1.48 7.44
Ophisthocomus hoazin 4.69 0.11 1.30 0.16 0.01 1.63 7.90
Balearica regulorum 3.35 0.14 1.51 0.24 0.01 0.83 6.08
Charadrius vociferus 4.53 0.13 1.12 0.20 0.01 1.05 7.03
Calypte anna 5.62 0.07 1.23 0.21 0.01 0.91 8.05
Chaetura pelagica 5.28 0.11 0.90 0.19 0.00 2.57 9.05
Antrostomus carolinensis 5.40 0.12 1.84 0.33 0.02 0.53 8.24
Chlamydotis macqueenii 3.97 0.17 1.40 0.23 0.00 0.57 6.35
Tauraco erythrolophus 2.76 0.09 1.80 0.16 0.01 3.83 8.64
Cuculus canorus 7.84 0.08 0.67 0.27 0.01 0.58 9.45
Mesitornis unicolor 4.62 0.09 1.38 0.38 0.01 1.03 7.51
Pterocles gutturalis 3.46 0.09 1.36 0.17 0.01 0.67 5.75
Columba livia 4.18 0.09 0.76 0.35 0.01 1.87 7.25
Phoenicopterus ruber 2.69 0.15 1.04 0.23 0.01 1.49 5.60
Podiceps cristatus 4.80 0.10 1.60 0.20 0.01 0.60 7.31
Gallus gallus 6.01 0.08 1.65 1.01 0.01 1.07 9.82
Meleagris gallopavo 5.40 0.05 1.11 0.82 0.00 0.52 7.90
Anas platyrhynchos 4.05 0.10 1.10 0.20 0.01 0.39 5.85
Struthio camelus 2.88 0.18 0.17 0.36 0.01 0.90 4.49
Tinamus guttatus 2.73 0.09 0.30 0.33 0.01 0.65 4.11